岩手県競馬組合創立25周年を記念し、1988年に北日本マイルチャンピオンシップ南部杯として創設、第1回は水沢競馬場のダート1600mで施行され、創設当初は地方競馬北日本地区のマイル最強馬決定戦の位置付けとされた。

　1995年に中央・地方全国指定交流競走に指定されたと同時に現在のマイルチャンピオンシップ南部杯に改名。北日本地区以外の地方所属馬及び中央競馬所属馬も出走可能になった。

　1996年には開催場を現在の盛岡競馬場に変更、1997年には前年から施行されたダートグレード競走のGIに格付けされ、日本の秋のダートのマイル最強馬決定戦として定着していった。

　過去の優勝馬には、アグネスデジタル、アドマイヤドン、ユートピア、エスポワールシチー、コパノリッキーなど、国内外で活躍したダート界の雄が名を連ねる。

　また、2001年からはJBCが新設されたことに伴い、JBC指定競走となり、優勝馬にはJBCクラシック、JBCスプリントの優先出走権が与えられることとなった。